Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
STRN3Q13033 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
STRN3Q13033 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
STRN3Q13033 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRN3Q13033 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
STRN3Q13033 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
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