Protein–RNA interactions for Protein: Q12173

TY3A-G, Transposon Ty3-G Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY3A-GQ12173 ZDS1YMR273C 2748 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 EXO5YBR163W 1758 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 TRX3YCR083W 384 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 PRP3YDR473C 1410 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 TOM20YGR082W 552 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 TIS11YLR136C 858 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 VTA1YLR181C 993 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 YNR071CYNR071C 1029 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 RAD17YOR368W 1206 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 ARG5,6YER069W 2592 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 SPB4YFL002C 1821 nt3.74□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 SPT6YGR116W 4356 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 PRP11YDL043C 801 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 GEP4YHR100C 558 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 YAL065CYAL065C 387 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 ERD2YBL040C 660 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 YOL079WYOL079W 399 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 RPA43YOR340C 981 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 PNG1YPL096W 1092 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 snR42snR42 351 nt3.73□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 FLO5YHR211W 3228 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 REB1YBR049C 2433 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 ELM1YKL048C 1923 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 PDX1YGR193C 1233 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 MTD1YKR080W 963 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 IST1YNL265C 897 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 SLM2YNL047C 1971 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 YHR202WYHR202W 1809 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 RPA190YOR341W 4995 nt3.72□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 GZF3YJL110C 1656 nt3.71□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 OAF3YKR064W 2592 nt3.71□□□□□ -1.81
TY3A-GQ12173 DHR2YKL078W 2208 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 SER3YER081W 1410 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YBR238CYBR238C 2196 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 AIM14YGL160W 1713 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 RAD26YJR035W 3258 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 MAF1YDR005C 1188 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 SPT15YER148W 723 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 CDC26YFR036W 375 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 RAI1YGL246C 1164 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YGR107WYGR107W 450 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 ECM16YMR128W 3804 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 WRS1YOL097C 1299 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 TIR2YOR010C 756 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 BUD27YFL023W 2391 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YGL140CYGL140C 3660 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 GPI10YGL142C 1851 nt3.71□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 HCA4YJL033W 2313 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 CLC1YGR167W 702 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 COS8YHL048W 1146 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 IES3YLR052W 753 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 GCD7YLR291C 1146 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YOR186WYOR186W 435 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 RPS12YOR369C 432 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 PRE2YPR103W 864 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 PGS1YCL004W 1566 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YOR022CYOR022C 2148 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 SLI1YGR212W 1407 nt3.7□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 CAF130YGR134W 3369 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 PPX1YHR201C 1194 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YIL047C-AYIL047C-A 369 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 ARC15YIL062C 465 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 REH1YLR387C 1299 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 MRPL16YBL038W 699 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 REX4YOL080C 870 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 ARO7YPR060C 771 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YLR177WYLR177W 1887 nt3.69□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 MDN1YLR106C 14733 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 BMH2YDR099W 822 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YDR526CYDR526C 471 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 RPL15AYLR029C 615 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YLR462WYLR462W 609 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YPT7YML001W 627 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 SSO2YMR183C 888 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 ZDS2YML109W 2829 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 RSE1YML049C 4086 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 GCN5YGR252W 1320 nt3.68□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 NHP10YDL002C 612 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 TRP4YDR354W 1143 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 USB1YLR132C 873 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 ERG2YMR202W 669 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 GAT2YMR136W 1683 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 PWP2YCR057C 2772 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YDR098C-AYDR098C-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YDR210C-CYDR210C-C 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YDR261C-CYDR261C-C 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YDR316W-AYDR316W-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YDR365W-AYDR365W-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YER137C-AYER137C-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YER159C-AYER159C-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YGR027W-AYGR027W-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YJR026WYJR026W 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YJR028WYJR028W 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YAR010CYAR010C 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
TY3A-GQ12173 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms