Protein–RNA interactions for Protein: Q12045

VIK1, Spindle pole body-associated protein VIK1, yeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VIK1	Q12045	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RPC34	YNR003C	954 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YNR068C	YNR068C	819 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	CNS1	YBR155W	1158 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	POF1	YCL047C	777 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	MDN1	YLR106C	14733 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	MDM38	YOL027C	1722 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	MIT1	YEL007W	2001 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	APN2	YBL019W	1563 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YPK3	YBR028C	1578 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RAD7	YJR052W	1698 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	SET1	YHR119W	3243 nt		3.46	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	PKH1	YDR490C	2301 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	ABD1	YBR236C	1311 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	MED2	YDL005C	1296 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	PAD1	YDR538W	729 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	IRC22	YEL001C	678 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RUF21	RUF21	707 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	DER1	YBR201W	636 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	SMP3	YOR149C	1551 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RRP5	YMR229C	5190 nt		3.45	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	NSE3	YDR288W	912 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YEL074W	YEL074W	339 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YER039C-A	YER039C-A	219 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	COS12	YGL263W	1143 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	GCD7	YLR291C	1146 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	VAM10	YOR068C	345 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	ECM8	YBR076W	1065 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YBR255C-A	YBR255C-A	363 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YMR018W	YMR018W	1545 nt		3.44	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	SQS1	YNL224C	2304 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	CHA4	YLR098C	1947 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	BUD16	YEL029C	939 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	IRC6	YFR043C	714 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	CIR1	YGR207C	786 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YIL089W	YIL089W	618 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YAL004W	YAL004W	648 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YKL177W	YKL177W	339 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YLR049C	YLR049C	1287 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	DCS1	YLR270W	1053 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	HTA2	YBL003C	399 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	TRI1	YMR233W	681 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	LCB5	YLR260W	2064 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	HMS1	YOR032C	1305 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	SRO9	YCL037C	1305 nt		3.43	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	GSC2	YGR032W	5688 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	QRI7	YDL104C	1224 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	DLS1	YJL065C	504 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RPS21A	YKR057W	264 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	AIM39	YOL053W	1188 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YBR137W	YBR137W	540 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	CSR2	YPR030W	3366 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	SER3	YER081W	1410 nt		3.42	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RRN6	YBL014C	2685 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RRN7	YJL025W	1545 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	CTR86	YCR054C	1692 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YCL068C	YCL068C	783 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YIR040C	YIR040C	333 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YNR071C	YNR071C	1029 nt		3.41	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	RSM23	YGL129C	1353 nt		3.4	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	THR4	YCR053W	1545 nt		3.4	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	SPS2	YDR522C	1509 nt		3.4	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	SLM2	YNL047C	1971 nt		3.4	□□□□□ -1.86
VIK1	Q12045	YGR219W	YGR219W	342 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	FUR1	YHR128W	651 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	PTM1	YKL039W	1572 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	MOH1	YBL049W	417 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	POS5	YPL188W	1245 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RPN6	YDL097C	1305 nt		3.4	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YDR271C	YDR271C	372 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	ERJ5	YFR041C	888 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	LSM1	YJL124C	519 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RPL17A	YKL180W	555 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RPS28B	YLR264W	204 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	URA4	YLR420W	1095 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RPS7A	YOR096W	573 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YPR077C	YPR077C	372 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	ERG9	YHR190W	1335 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	CLB5	YPR120C	1308 nt		3.39	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	AIP1	YMR092C	1848 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	HDA2	YDR295C	2025 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	AAD3	YCR107W	1092 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YEL032C-A	YEL032C-A	162 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	IGO2	YHR132W-A	396 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	GAT3	YLR013W	426 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	REX3	YLR107W	1215 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	IZH2	YOL002C	954 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SPS4	YOR313C	1017 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SPT10	YJL127C	1923 nt		3.38	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SIZ1	YDR409W	2715 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SKN7	YHR206W	1869 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	YDR149C	YDR149C	708 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RMD5	YDR255C	1266 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	SCL1	YGL011C	759 nt		3.37	□□□□□ -1.87
VIK1	Q12045	RHO5	YNL180C	996 nt		3.37	□□□□□ -1.87

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