Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBL2Q08999 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RBL2Q08999 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms