Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 RSF2YJR127C 4143 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 SDT1YGL224C 843 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 GMH1YKR030W 822 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 RUF21RUF21 707 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 MFA2YNL145W 117 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 PSF3YOL146W 585 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 AIM41YOR215C 558 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 MRPS9YBR146W 837 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 SLM5YCR024C 1479 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YHL012WYHL012W 1482 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 GAT2YMR136W 1683 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 RAD4YER162C 2265 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 NUP85YJR042W 2235 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 DHR2YKL078W 2208 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 TAF6YGL112C 1551 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 MPC54YOR177C 1395 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YTM1YOR272W 1383 nt3□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 POL1YNL102W 4407 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 SPT16YGL207W 3108 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YDR391CYDR391C 699 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 RAI1YGL246C 1164 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 COS8YHL048W 1146 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 RPL22AYLR061W 366 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 RFC3YNL290W 1023 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YOR186WYOR186W 435 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 HCA4YJL033W 2313 nt2.99□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 STT4YLR305C 5703 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 NUP60YAR002W 1620 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YJL028WYJL028W 336 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 MBR1YKL093W 1020 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 SHH3YMR118C 591 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 DSE3YOR264W 1293 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 FUN12YAL035W 3009 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 UBP12YJL197W 3765 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 UTP25YIL091C 2166 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YKL050CYKL050C 2769 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 THR4YCR053W 1545 nt2.98□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 YMR1YJR110W 2067 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 PRS5YOL061W 1491 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 PRP3YDR473C 1410 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 CIT1YNR001C 1440 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 PCL9YDL179W 915 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 FMP32YFL046W 624 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 ERG26YGL001C 1050 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 ENT3YJR125C 1227 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 AIM39YOL053W 1188 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 SUI3YPL237W 858 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 IOC2YLR095C 2439 nt2.97□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 CMK1YFR014C 1341 nt2.96□□□□□ -1.93
NIP7Q08962 TDA3YHR009C 1572 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 VID27YNL212W 2349 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 YDR526CYDR526C 471 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 YER147C-AYER147C-A 411 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 ARD1YHR013C 717 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 SDS3YIL084C 984 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 YAL004WYAL004W 648 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 GTT2YLL060C 702 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 TPM1YNL079C 600 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 DDP1YOR163W 567 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 RAD17YOR368W 1206 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 PMT6YGR199W 2280 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 RRP5YMR229C 5190 nt2.96□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 IMH1YLR309C 2736 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 ARG5,6YER069W 2592 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 LSM6YDR378C 261 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 RRP17YDR412W 708 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 GEP4YHR100C 558 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 SFH5YJL145W 885 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 ERB1YMR049C 2424 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 NRP1YDL167C 2160 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 POL31YJR006W 1464 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 PGS1YCL004W 1566 nt2.95□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 AUS1YOR011W 4185 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 YBR238CYBR238C 2196 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 MSR1YHR091C 1932 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 FAP7YDL166C 594 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 PSF1YDR013W 627 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 ERV29YGR284C 933 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 CDA2YLR308W 939 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 STU2YLR045C 2667 nt2.94□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 SHQ1YIL104C 1524 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 RRN7YJL025W 1545 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 DNM1YLL001W 2274 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 ORC4YPR162C 1590 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 ERJ5YFR041C 888 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 ARC15YIL062C 465 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 YET2YMR040W 483 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 SSO2YMR183C 888 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 YOL050CYOL050C 321 nt2.93□□□□□ -1.94
NIP7Q08962 SCD6YPR129W 1050 nt2.93□□□□□ -1.94
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