Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TFF3Q07654 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TFF3Q07654 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms