Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDC42EP1Q00587 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDC42EP1Q00587 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms