Protein–RNA interactions for Protein: P86397

HTD2, Hydroxyacyl-thioester dehydratase type 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTD2P86397 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HTD2P86397 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HTD2P86397 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTD2P86397 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTD2P86397 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTD2P86397 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTD2P86397 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HTD2P86397 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HTD2P86397 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTD2P86397 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTD2P86397 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTD2P86397 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HTD2P86397 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HTD2P86397 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HTD2P86397 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTD2P86397 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTD2P86397 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTD2P86397 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTD2P86397 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HTD2P86397 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms