Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SH3BP2P78314 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SH3BP2P78314 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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