Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM4P67936 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM4P67936 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TPM4P67936 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TPM4P67936 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TPM4P67936 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TPM4P67936 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TPM4P67936 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TPM4P67936 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms