Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SNAP25P60880 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNAP25P60880 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms