Protein–RNA interactions for Protein: P56962

STX17, Syntaxin-17, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX17P56962 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STX17P56962 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX17P56962 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX17P56962 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX17P56962 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STX17P56962 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STX17P56962 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STX17P56962 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
STX17P56962 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
STX17P56962 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
STX17P56962 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
STX17P56962 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
STX17P56962 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
STX17P56962 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms