Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BACE1P56817 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BACE1P56817 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BACE1P56817 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BACE1P56817 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BACE1P56817 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BACE1P56817 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BACE1P56817 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BACE1P56817 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BACE1P56817 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms