Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTBP2P56545 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTBP2P56545 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTBP2P56545 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTBP2P56545 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTBP2P56545 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTBP2P56545 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CTBP2P56545 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTBP2P56545 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms