Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC4P56524 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HDAC4P56524 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms