Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EIF3BP55884 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EIF3BP55884 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms