Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP1B3P54709 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP1B3P54709 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms