Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CASP4P49662 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CASP4P49662 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP4P49662 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP4P49662 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CASP4P49662 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CASP4P49662 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CASP4P49662 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CASP4P49662 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CASP4P49662 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms