Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNNI2P48788 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNNI2P48788 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms