Protein–RNA interactions for Protein: P48436

SOX9, Transcription factor SOX-9, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9P48436 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SOX9P48436 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SOX9P48436 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SOX9P48436 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SOX9P48436 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SOX9P48436 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SOX9P48436 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX9P48436 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX9P48436 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms