Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ME1P48163 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ME1P48163 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ME1P48163 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ME1P48163 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ME1P48163 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ME1P48163 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ME1P48163 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ME1P48163 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ME1P48163 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ME1P48163 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms