Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ALDH1A3P47895 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ALDH1A3P47895 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms