Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTGER3P43115 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTGER3P43115 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms