Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MTHFRP42898 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MTHFRP42898 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MTHFRP42898 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms