Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIA3P42263 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIA3P42263 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRIA3P42263 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRIA3P42263 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA3P42263 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms