Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ECM8YBR076W 1065 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 BMT2YBR141C 1014 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 PPQ1YPL179W 1650 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 UTP25YIL091C 2166 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 SPT16YGL207W 3108 nt3.35□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YAK1YJL141C 2424 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 PGS1YCL004W 1566 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 ATG26YLR189C 3597 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 STE14YDR410C 720 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 HAT2YEL056W 1206 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 YOL050CYOL050C 321 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 CTR1YPR124W 1221 nt3.34□□□□□ -1.87
DDI1P40087 MGA1YGR249W 1371 nt3.34□□□□□ -1.88
DDI1P40087 FUN12YAL035W 3009 nt3.34□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SAS4YDR181C 1446 nt3.34□□□□□ -1.88
DDI1P40087 GLC3YEL011W 2115 nt3.34□□□□□ -1.88
DDI1P40087 NRP1YDL167C 2160 nt3.34□□□□□ -1.88
DDI1P40087 EPO1YMR124W 2832 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YMR1YJR110W 2067 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 RPC11YDR045C 333 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 AIM7YDR063W 450 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YFT2YDR319C 825 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 USE1YGL098W 738 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 ENT3YJR125C 1227 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YLR049CYLR049C 1287 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YOR338WYOR338W 1092 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 POF1YCL047C 777 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YBR238CYBR238C 2196 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SSU1YPL092W 1377 nt3.33□□□□□ -1.88
DDI1P40087 MSD1YPL104W 1977 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 ARC15YIL062C 465 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YUH1YJR099W 711 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YLR225CYLR225C 1224 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YMR084WYMR084W 789 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 TRI1YMR233W 681 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 RPS7AYOR096W 573 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YOR314WYOR314W 330 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 DER1YBR201W 636 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 CLB5YPR120C 1308 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 PFK26YIL107C 2484 nt3.32□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SQS1YNL224C 2304 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 RAD7YJR052W 1698 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 MEK1YOR351C 1494 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 ALG1YBR110W 1350 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 MTR2YKL186C 555 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YKT6YKL196C 603 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SIL1YOL031C 1266 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YPL088WYPL088W 1029 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 TAF14YPL129W 735 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 RRN6YBL014C 2685 nt3.31□□□□□ -1.88
DDI1P40087 GPI1YGR216C 1830 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YGR117CYGR117C 1431 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 HMS1YOR032C 1305 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 snR57snR57 88 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 REH1YLR387C 1299 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 GLO4YOR040W 858 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 HMT1YBR034C 1047 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 MCM16YPR046W 546 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 OPY1YBR129C 987 nt3.3□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SER3YER081W 1410 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 ZDS2YML109W 2829 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YCR007CYCR007C 720 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 TMA17YDL110C 453 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 OKP1YGR179C 1221 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SPO16YHR153C 597 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YAL004WYAL004W 648 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 RAD33YML011C 534 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 DSC2YOL073C 969 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SLA1YBL007C 3735 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 DSN1YIR010W 1731 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 TCB3YML072C 4638 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 THR4YCR053W 1545 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SMI1YGR229C 1518 nt3.29□□□□□ -1.88
DDI1P40087 ULP1YPL020C 1866 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 NEM1YHR004C 1341 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SSE2YBR169C 2082 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 TRP4YDR354W 1143 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YIL089WYIL089W 618 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 POG1YIL122W 1056 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 DLS1YJL065C 504 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 REE1YJL217W 597 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 MOH1YBL049W 417 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YBR137WYBR137W 540 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 YPK3YBR028C 1578 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 AUS1YOR011W 4185 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 GWT1YJL091C 1473 nt3.28□□□□□ -1.88
DDI1P40087 SEC6YIL068C 2418 nt3.28□□□□□ -1.89
DDI1P40087 IMH1YLR309C 2736 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 CTK1YKL139W 1587 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 IRC22YEL001C 678 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PUG1YER185W 912 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 TOS8YGL096W 831 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 TYS1YGR185C 1185 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 PEX21YGR239C 867 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 BCD1YHR040W 1101 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 BET1YIL004C 429 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 URA4YLR420W 1095 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 TVP18YMR071C 504 nt3.27□□□□□ -1.89
DDI1P40087 GIS2YNL255C 462 nt3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.1 ms