Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GRIK1P39086 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GRIK1P39086 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms