Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AL121790.1-201ENST00000554829 738 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 LINC01108-202ENST00000635227 776 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC025244.1-201ENST00000505930 469 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC022395.1-201ENST00000451610 895 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC005534.1-201ENST00000455709 742 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 NUDT4-205ENST00000548662 765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXD11P31277 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AL121694.1-201ENST00000554253 671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MS4A6A-201ENST00000412309 1284 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC013469.1-201ENST00000426985 403 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXD11P31277 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms