Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXC13P31276 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXC13P31276 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms