Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CMPK1P30085 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CMPK1P30085 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms