Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CD27P26842 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CD27P26842 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CD27P26842 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CD27P26842 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CD27P26842 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CD27P26842 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CD27P26842 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CD27P26842 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD27P26842 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD27P26842 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD27P26842 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD27P26842 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD27P26842 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD27P26842 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CD27P26842 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CD27P26842 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms