Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
HMGB2P26583 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HMGB2P26583 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms