Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CTNNA2P26232 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CTNNA2P26232 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms