Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATP2B4P23634 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATP2B4P23634 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B4P23634 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B4P23634 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B4P23634 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B4P23634 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP2B4P23634 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms