Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFSF4P23510 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFSF4P23510 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms