Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SP100P23497 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SP100P23497 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SP100P23497 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SP100P23497 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SP100P23497 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SP100P23497 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP100P23497 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP100P23497 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP100P23497 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP100P23497 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP100P23497 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP100P23497 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SP100P23497 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP100P23497 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP100P23497 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms