Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATP4AP20648 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATP4AP20648 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms