Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PVALBP20472 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PVALBP20472 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PVALBP20472 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PVALBP20472 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PVALBP20472 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PVALBP20472 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PVALBP20472 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PVALBP20472 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PVALBP20472 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PVALBP20472 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms