Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AMY2BP19961 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
AMY2BP19961 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms