Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPRAP18433 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPRAP18433 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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