Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM27P14373 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM27P14373 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
TRIM27P14373 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM27P14373 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM27P14373 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM27P14373 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM27P14373 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM27P14373 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM27P14373 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM27P14373 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM27P14373 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM27P14373 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms