Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1P11387 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP1P11387 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP1P11387 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP1P11387 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1P11387 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1P11387 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1P11387 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1P11387 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1P11387 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1P11387 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1P11387 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1P11387 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1P11387 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1P11387 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1P11387 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1P11387 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1P11387 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1P11387 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOP1P11387 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOP1P11387 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TOP1P11387 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms