Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GLI3P10071 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GLI3P10071 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GLI3P10071 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GLI3P10071 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GLI3P10071 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI3P10071 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI3P10071 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI3P10071 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI3P10071 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI3P10071 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GLI3P10071 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GLI3P10071 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI3P10071 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI3P10071 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI3P10071 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI3P10071 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI3P10071 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI3P10071 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI3P10071 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GLI3P10071 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI3P10071 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI3P10071 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI3P10071 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GLI3P10071 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI3P10071 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29■■■□□ 2.23
GLI3P10071 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GLI3P10071 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms