Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SMIM13P0DJ93 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMIM13P0DJ93 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms