Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC172P0C7W6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC172P0C7W6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 373.5 ms