Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PARP1P09874 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP1P09874 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP1P09874 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP1P09874 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP1P09874 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP1P09874 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP1P09874 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARP1P09874 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP1P09874 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP1P09874 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP1P09874 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP1P09874 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARP1P09874 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARP1P09874 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARP1P09874 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARP1P09874 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARP1P09874 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PARP1P09874 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PARP1P09874 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms