Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NGFRP08138 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
NGFRP08138 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NGFRP08138 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NGFRP08138 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NGFRP08138 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms