Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPBP07199 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPBP07199 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPBP07199 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPBP07199 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPBP07199 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPBP07199 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CENPBP07199 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CENPBP07199 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CENPBP07199 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPBP07199 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPBP07199 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPBP07199 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPBP07199 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPBP07199 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CENPBP07199 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CENPBP07199 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CENPBP07199 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CENPBP07199 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CENPBP07199 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CENPBP07199 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CENPBP07199 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CENPBP07199 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CENPBP07199 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CENPBP07199 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CENPBP07199 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CENPBP07199 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms