Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCCAP05165 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCCAP05165 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCCAP05165 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCCAP05165 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCCAP05165 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCCAP05165 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PCCAP05165 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCCAP05165 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCCAP05165 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCCAP05165 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCCAP05165 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCCAP05165 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCCAP05165 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCCAP05165 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCCAP05165 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCCAP05165 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCCAP05165 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCAP05165 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCAP05165 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCAP05165 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCAP05165 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCAP05165 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCAP05165 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCCAP05165 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCCAP05165 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
PCCAP05165 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms