Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
A1BGP04217 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
A1BGP04217 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
A1BGP04217 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
A1BGP04217 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1BGP04217 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1BGP04217 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1BGP04217 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1BGP04217 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1BGP04217 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1BGP04217 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
A1BGP04217 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
A1BGP04217 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
A1BGP04217 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
A1BGP04217 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
A1BGP04217 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1BGP04217 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1BGP04217 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1BGP04217 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1BGP04217 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1BGP04217 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
A1BGP04217 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
A1BGP04217 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
A1BGP04217 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
A1BGP04217 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
A1BGP04217 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1BGP04217 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1BGP04217 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1BGP04217 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1BGP04217 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1BGP04217 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A1BGP04217 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
A1BGP04217 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A1BGP04217 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A1BGP04217 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms